一、宗旨：塑造世界一流的自然科學研究學者與團隊。
二、申請機構（即執行機構）及申請人（即計畫主持人）資格：
(一) 申請機構：符合本部專題研究計畫作業要點第二點規定者。
(二) 計畫主持人資格：符合本部專題研究計畫作業要點第三點規定者，但不含第二款之人員。
三、申請：
研究計畫之申請及審查採「構想書」及「計畫書」兩階段辦理。
(一) 構想書階段：
申請人(整合型計畫為總主持人)於104年9月30日(星期三)下午6點前(以電子郵件為憑)，備齊構想書與個人資料表彙整成冊，以PDF格式製作電子檔1份，逕寄科技部自然司高世平研究員spkao@most.gov.tw (不必備函，本司收到E-mail完整資料後，即以E-mail回覆)，寄件主旨請註明【卓越領航構想計畫書】或【Science Vanguard Research Program】。文件不全、不符合規定或未依規定期限提出申請者，不予受理。
(二) 計畫書階段：
構想書審查結果通過者，申請人依本部補助專題研究計畫作業要點規定，至本部網站線上製作及傳送研究計畫書，由申請機構線上彙整送出並造具申請名冊1式2份經有關人員核章後，於105年2月25日(星期四)下午6時前備函送達本部。文件不全、不符合規定或未依規定期限提出申請者，不予受理。
(三) 本計畫每年限同時申請與執行1件申請案。同一年度已執行攻頂計畫、自由卓越型計畫、國家型計畫者不得申請。
(四) 申請執行期限至多4年，自105年8月1日開始執行。
四、審查：
(一) 審查方式：依本部專題研究計畫審查方式，辦理初、複審。必要時，得邀請計畫主持人簡報。
(二) 審查重點：
        1.  計畫內容之創新性、前瞻性、國際競爭力。
        2.  計畫主持人（含整合型計畫總主持人）過去之研究成果(以近5年優先考量，整體成績相仿者則年輕學者優先)。
        3.  申請機構提供之配合措施（例如經費、空間、設備、人力等）。
五、核定：
(一) 每年度至多補助新案5件為原則。
(二) 每一計畫每年補助金額以不超過新台幣1,500 萬元為原則。
(三) 構想書或計畫書審查未獲通過者，不得申覆。
六、經費補助項目與研究主持費：
經費補助項目(含研究主持費)依本部補助專題研究計畫作業要點規定辦理。
七、考評：
(一) 期中考評﹕計畫主持人應於各年計畫執行期滿前二個月繳交進度報告(內容包含：計畫執行進度、初步研究成果、未來執行重點等)，由本司邀請學者專家進行書面審查，並得視需要邀請主持人與會簡報或進行實地考評，以核定下一年度經費，未能達到預期進度成果之計畫，本司得終止補助。
(二) 全程計畫考評：計畫主持人於全程計畫結束後三個月內繳交研究成果報告，由本司邀請學者專家進行書面審查，並召開成果評鑑會議；必要時，得進行實地查訪。
八、其他事項：
除前開事項外，本計畫之簽約撥款、補助經費項目、經費結報及研究成果報告繳交等未盡事宜，依本部補助專題研究計畫作業要點、本部補助專題研究計畫經費處理原則、專題研究計畫補助合約書與執行同意書及其他有關規定辦理。
九、自然司學門領域參考表

統計【Statistics】	地球科學【Earth Science】
數學【Mathematics】	大氣科學【Atmospheric Science】
物理【Physics】	海洋科學【Oceanography】
化學【Chemistry】	永續發展研究【Sustainable Development】

十、 聯絡窗口：
高世平研究員，電話：02-27377521，Email：spkao@most.gov.tw
林綠小姐，電話：02-27371734，Email：soa237@most.gov.tw
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